Rotenkirchen ist ein am Ahlsburg liegender Ortsteil der Stadt Einbeck in Niedersachsen südwestlich des Stadtkerns. In seiner Nähe befindet sich die Burgruine Grubenhagen.

Das Dorf Rotenkirchen findet im Jahr 1203 erste urkundliche Erwähnung. Während der Belagerung der Burg Grubenhagen 1448 durch den Landgrafen Ludwig I. (Hessen) wurde Rotenkirchen zerstört.

Die umliegenden Ortschaften Edemissen, Dörrigsen, Odagsen, Iber, Strodthagen, Buensen, Stöckheim, Wetze, das Landgut Wickershausen, Dassensen, Wellersen, Hullersen, Holtensen, Vardeilsen, Avendshausen, Rengershausen, Kuventhal, Andershausen und Kohnsen gehörten bis 1826 zum Amt Rotenkirchen. Danach wurde es mit dem Amt Salzderhelden vereinigt und der Amtssitz mit der Bezeichnung Grubenhagen nach Salzderhelden verlegt.

Rotenkirchen wurde 1974 durch Eingemeindung zum Ortsteil der Stadt Einbeck.