Kirchengemeinde St.Jacobi
Diese Feldsteinkirche wurde in der 1. Hälfte des 13. Jahrhunderts erbaut. Alten Überlieferungen zu Folge soll sich an diesem Ort ursprünglich einmal ein alter Tempel befunden haben, der dem dreiköpfigen Gott der Wenden, Triglav, geweiht war.
Trotz ihrer Kriegswunden, ihrer äußeren Gestalt und baulichen Sustanz nach heute, ist die Feldsteinkirche St. Jacobi die älteste genutzte christliche Kirche der Stadt.
Im Jahre 1945 wurde die St. Jacobi-Kirche angezündet und so bis auf die Grundmauern zerstört.
Die St. Jacobi-Kirche ist das Zentrum der mitgliederstärksten Kirchengemeinde der Stadt. Mehr als die Hälfte der evangelischen Christen Prenzlaus gehören zu ihr.
Prenzlau und Stettin sind durch die so genannte via regia (Hauptstraße) verbunden, an deren beiden Enden sich eine St. Jacobi-Kirche befindet. Dies könnte dafür sprechen, dass hier, ähnlich wie im Süden Deutschlands, einstmals ein alter Pilgerweg zum bekanntesten Wallfahrtsort des Mittelalters, Santiago de Compostela in Nordspanien, verlief.
Evangelische Kirche St.Sabinen
Diese Kirche ist das älteste Bauwerk am Uckersee. Sie war dem St. Sabinus geweiht, der als Bischof in Italien lebte und um Hilfe angerufen wurde bei Überschwemmungen. Ausschlaggebend für den Namen muss wohl die unsichere Lage direkt am See sein. Im deutschsprachigen Raum ist der Name St.Sabinen einmalig.
Den Kirchenbau kann man um etwa 1170 ansetzen. Es handelt sich hierbei um einen rechteckigen Saalbau.
Etwa um 1235 bis 1240 wurde die St.Sabinen Kirche dem neuentstandenen Kloster, welches südlich der Kirche am Uckersee stand, als Klosterkirche zugewiesen.
Schutzheilige war Maria Magdalena.
1559 wurde das Kloster aufgelöst und so wurde die Klosterkirche zur evangelischen Pfarrkirche der Unterstadt.
Im Jahre 1799 musste die Kirche aufgrund der Folgen einer Überschwemmung geschlossen werden. In den Jahren 1816-1817 entstand sie neu und ist so bis heute erhalten.
Teile der alten Glasfenster von 1817 sind erhalten.
Kirchengemeinde St. Marien
Baubeginn der ersten Hallenkirche Norddeutschlands war im Jahre 1235. Im Jahr 1250 wurde sie zur Hauptpfarrkirche in Prenzlau. Der Neubau erfolgte in zwei Bauphasen (1289 - 1340) unter Einbeziehung des Westteils vom Vorgängerbau. Die Kapellen-Anbauten stammen aus dem 14./15. Jahrhundert. Das heutige Aussehen erhielt der Nordturm mit einer Höhe von 68 m im 16. Jahrhundert, der Südturm mit 64 m Höhe im 18. Jahrhundert.
In den letzten Tagen des 2. Weltkrieges 1945 wurde die Marienkirche von einem verheerenden Brand zerstört. Erst ab 1970 - 1995 erfolgte der Wiederaufbau.
Zum besonderen Inventar der Marienkirche gehören die Altarfiguren des Marienaltars (1512).
St. Nikolai Kirche
Am 5. Mai 1275 wurde diese Kirche zu Ehren des Heiligen Kreuzes gegründet und gebaut.
Es handelt sich um einen typischen frühgotischen Backsteinbau.
Durch die vielen hohen Fenster ist die Kirche stets gut ausgeleuchtet.
Die Kirche war von vornherein als Klosterkirche ohne Turm geplant.
Am 12. März 1343 wurden die Kirche und der Hochaltar geweiht, der zur Ehre des Heiligen Kreuzes, der drei Könige und der 10.000 Soldaten errichtet worden war.
Die Kirche war Teil des Dominikanerklosters. Diese Zusammengehörigkeit unterstreicht die Tür der Kirche. In der Südwand befindet sich noch der verschlossene Treppengang, durch den die Mönche direkt vom Obergeschoss des Klosters zu den Gebetszeiten in die Kirche kamen.
In einem Teil der Klausurgebäude befindet sich heute das Kulturhistorische Museum der Stadt Prenzlau.
Katholische St. Maria Magdalena Kirche
Diese Kirche wurde im Jahre 1892 im neogotischen Stil errichtet. Nach ihrer Zerstörung (1945) wurde die Kirche 1952 wieder aufgebaut.